Publicaciones
Trabajos seleccionados a través de mi programa de investigación
Estos trabajos muestran cómo la ecología de campo, la biología del estrés ambiental y los enfoques moleculares han ido convergiendo hacia preguntas sobre organización biológica y resiliencia.
Publicaciones seleccionadas revisadas por pares
Recurso de ecotoxicogenómica para un organismo no modelo
Escobar-Sierra, C., Hassan, S., Weichert, F. G., Aronsson, H., Lampert, K. P., Hollert, H., Backhaus, T., & Inostroza, P. A. (2025).
De novo transcriptome assembly and annotation of the common freshwater amphipod (Gammarus pulex): a valuable resource for ecotoxicogenomics. Scientific Data, 12, 1502.
DOI
Por qué es relevante: Un recurso molecular abierto diseñado para facilitar ecotoxicogenómica reproducible en un organismo centinela de agua dulce ampliamente utilizado y no modelo.
Transcriptómica comparativa multitejido en peces
Escobar-Sierra, C., Cañedo-Argüelles, M., Vinyoles, D., & Lampert, K. P. (2024).
Unraveling the molecular mechanisms of fish physiological response to freshwater salinization: A comparative multi-tissue transcriptomic study in a river polluted by potash mining. Environmental Pollution, 357, 124400.
DOI
Por qué es relevante: Conectó una exposición ambientalmente realista con mecanismos de respuesta molecular específicos y compartidos entre cerebro, branquias e hígado.
Transcriptómica de novo aplicada en campo
Escobar-Sierra, C. & Lampert, K. P. (2024).
Field application of de novo transcriptomic analysis to evaluate the effects of sublethal freshwater salinization on Gasterosteus aculeatus in urban streams. PLOS ONE, 19, e0298213.
DOI
Por qué es relevante: Mostró cómo la transcriptómica de novo puede recuperar respuestas mecanísticas subletales directamente en peces silvestres bajo condiciones de campo complejas.
Teoría de estresores múltiples
Vos, M., Hering, D., Gessner, M. O., et al., Escobar-Sierra, C., et al. (2023).
The Asymmetric Response Concept explains ecological consequences of multiple stressor exposure and release. Science of the Total Environment, 872, 162196.
DOI
Por qué es relevante: Contribuyó a un marco conceptual más amplio para entender por qué la respuesta ecológica al aumento y a la liberación de estresores no tiene que seguir la misma trayectoria.
Ecología y ómicas
Escobar-Sierra, C., de Kock, W., Hasler-Sheetal, H., Holmer, M., Chatzigeorgiou, G., Tsapakis, M., & Apostolaki, E. T. (2023).
Metabolomics unravels grazing interactions under nutrient enrichment from aquaculture. Diversity, 15, 31.
DOI
Por qué es relevante: Una integración temprana entre experimentación ecológica y un enfoque ómico, conectando el enriquecimiento de nutrientes asociado a la acuicultura con respuestas metabólicas a nivel de comunidad.
Software
EchoGO
Escobar-Sierra, C., Langschied, F., Miller, A., & Inostroza, P. A.
Marco abierto en R para la interpretación funcional sensible al contexto de anotación en eco-ómicas de organismos no modelo.
Recursos de datos
Recurso transcriptómico de Gammarus pulex
Un recurso molecular abierto descrito en el artículo de Scientific Data anterior. El DOI del artículo es el punto de entrada estable a la información sobre disponibilidad de los datos.
Compendios de investigación
Compendio de ecotoxicogenómica de Gammarus en el Holtemme
Un compendio de investigación reproducible y versionado que integra química ambiental, RNA-seq, interpretación funcional y análisis de redes.
Registro completo de publicaciones
Para consultar la lista completa: